Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTLC1O15269 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTLC1O15269 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTLC1O15269 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTLC1O15269 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTLC1O15269 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTLC1O15269 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms