Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA5O15230 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LAMA5O15230 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms