Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CITO14578 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CITO14578 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CITO14578 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CITO14578 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CITO14578 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CITO14578 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CITO14578 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CITO14578 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CITO14578 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CITO14578 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CITO14578 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CITO14578 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CITO14578 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CITO14578 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CITO14578 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CITO14578 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CITO14578 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CITO14578 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CITO14578 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CITO14578 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CITO14578 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CITO14578 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CITO14578 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CITO14578 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CITO14578 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CITO14578 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CITO14578 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CITO14578 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CITO14578 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CITO14578 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CITO14578 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CITO14578 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CITO14578 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CITO14578 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CITO14578 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CITO14578 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CITO14578 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CITO14578 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CITO14578 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CITO14578 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CITO14578 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CITO14578 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CITO14578 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CITO14578 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CITO14578 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CITO14578 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CITO14578 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CITO14578 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CITO14578 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CITO14578 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CITO14578 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CITO14578 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CITO14578 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CITO14578 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CITO14578 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CITO14578 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CITO14578 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CITO14578 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CITO14578 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CITO14578 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CITO14578 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CITO14578 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CITO14578 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CITO14578 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CITO14578 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CITO14578 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CITO14578 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CITO14578 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CITO14578 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CITO14578 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CITO14578 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CITO14578 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CITO14578 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CITO14578 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CITO14578 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CITO14578 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CITO14578 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CITO14578 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CITO14578 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CITO14578 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CITO14578 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CITO14578 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CITO14578 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CITO14578 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CITO14578 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CITO14578 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CITO14578 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CITO14578 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CITO14578 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CITO14578 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CITO14578 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CITO14578 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CITO14578 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CITO14578 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CITO14578 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CITO14578 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CITO14578 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CITO14578 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CITO14578 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms