Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX7O00628 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX7O00628 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX7O00628 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX7O00628 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX7O00628 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEX7O00628 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX7O00628 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX7O00628 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX7O00628 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX7O00628 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX7O00628 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX7O00628 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX7O00628 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX7O00628 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX7O00628 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX7O00628 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX7O00628 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX7O00628 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX7O00628 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX7O00628 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX7O00628 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX7O00628 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX7O00628 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX7O00628 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX7O00628 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX7O00628 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX7O00628 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX7O00628 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX7O00628 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX7O00628 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX7O00628 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX7O00628 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX7O00628 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX7O00628 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX7O00628 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX7O00628 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX7O00628 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX7O00628 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX7O00628 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX7O00628 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX7O00628 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX7O00628 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX7O00628 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX7O00628 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX7O00628 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX7O00628 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX7O00628 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX7O00628 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX7O00628 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX7O00628 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX7O00628 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX7O00628 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX7O00628 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX7O00628 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX7O00628 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX7O00628 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX7O00628 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX7O00628 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX7O00628 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX7O00628 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX7O00628 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX7O00628 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX7O00628 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX7O00628 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX7O00628 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX7O00628 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX7O00628 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX7O00628 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX7O00628 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX7O00628 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX7O00628 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX7O00628 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX7O00628 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX7O00628 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX7O00628 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX7O00628 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX7O00628 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX7O00628 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX7O00628 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX7O00628 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX7O00628 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX7O00628 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX7O00628 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX7O00628 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX7O00628 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX7O00628 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX7O00628 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX7O00628 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX7O00628 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX7O00628 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX7O00628 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX7O00628 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX7O00628 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX7O00628 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX7O00628 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX7O00628 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX7O00628 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX7O00628 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX7O00628 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms