Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 RHNO1-201ENST00000366285 517 ntTSL 513.34□□□□□ -0.271e-12■■■■■ 48.2
DDX3XO00571 RHNO1-206ENST00000536063 516 ntTSL 35.51□□□□□ -1.531e-12■■■■■ 48.2
DDX3XO00571 RHNO1-208ENST00000538700 580 ntTSL 44.57□□□□□ -1.681e-12■■■■■ 48.2
DDX3XO00571 SRPRB-204ENST00000484684 512 ntTSL 215.85■□□□□ 0.139e-36■■■■■ 48.1
DDX3XO00571 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.089e-36■■■■■ 48.1
DDX3XO00571 ZNF558-206ENST00000599938 780 ntTSL 528.9■■■□□ 2.225e-7■■■■■ 48
DDX3XO00571 C2CD2L-204ENST00000528271 536 ntTSL 426.1■■□□□ 1.775e-10■■■■■ 48
DDX3XO00571 ZNF558-203ENST00000595786 741 ntTSL 325.8■■□□□ 1.725e-7■■■■■ 48
DDX3XO00571 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.645e-7■■■■■ 48
DDX3XO00571 C2CD2L-206ENST00000529600 643 ntTSL 424.46■■□□□ 1.515e-10■■■■■ 48
DDX3XO00571 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.035e-7■■■■■ 48
DDX3XO00571 C2CD2L-203ENST00000527854 569 ntTSL 420.54■□□□□ 0.885e-10■■■■■ 48
DDX3XO00571 MAP1B-205ENST00000512974 580 ntTSL 419.81■□□□□ 0.761e-7■■■■■ 48
DDX3XO00571 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.644e-7■■■■■ 48
DDX3XO00571 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.635e-10■■■■■ 48
DDX3XO00571 ZNF558-204ENST00000596172 547 ntTSL 418.93■□□□□ 0.625e-7■■■■■ 48
DDX3XO00571 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 48
DDX3XO00571 C2CD2L-210ENST00000534024 500 ntTSL 418.53■□□□□ 0.565e-10■■■■■ 48
DDX3XO00571 CDC26-202ENST00000490408 703 ntTSL 318.37■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 48
DDX3XO00571 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.427e-19■■■■■ 48
DDX3XO00571 C2CD2L-208ENST00000529885 561 ntTSL 417.5■□□□□ 0.395e-10■■■■■ 48
DDX3XO00571 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.327e-19■■■■■ 48
DDX3XO00571 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.327e-19■■■■■ 48
DDX3XO00571 FLAD1-210ENST00000487371 757 ntTSL 316.34■□□□□ 0.217e-19■■■■■ 48
DDX3XO00571 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.067e-19■■■■■ 48
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DDX3XO00571 ZNF558-207ENST00000601372 7032 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 48
DDX3XO00571 ZNF558-202ENST00000593891 292 ntTSL 511.17□□□□□ -0.625e-7■■■■■ 48
DDX3XO00571 FLAD1-212ENST00000492620 727 ntTSL 310.89□□□□□ -0.677e-19■■■■■ 48
DDX3XO00571 MAP1B-201ENST00000296755 12036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 48
DDX3XO00571 GJC1-208ENST00000591424 586 ntTSL 38.24□□□□□ -1.095e-7■■■■■ 48
DDX3XO00571 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.235e-7■■■■■ 48
DDX3XO00571 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.335e-7■■■■■ 48
DDX3XO00571 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.022e-14■■■■■ 48
DDX3XO00571 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.031e-11■■■■■ 48
DDX3XO00571 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.251e-11■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.081e-11■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 B4GALNT1-210ENST00000551220 837 ntTSL 420.42■□□□□ 0.861e-11■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.221e-11■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 B4GALNT1-216ENST00000553142 5580 ntTSL 215.16■□□□□ 0.021e-11■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.34e-8■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.614e-8■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 TMEM64-206ENST00000521852 587 ntTSL 418.54■□□□□ 0.564e-8■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 PLEKHG4-214ENST00000568621 514 ntTSL 325.6■■□□□ 1.692e-10■■■■■ 47.9
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DDX3XO00571 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.932e-10■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.492e-10■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 PLEKHG4-209ENST00000563969 6949 ntTSL 217.32■□□□□ 0.362e-10■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 PLEKHG4-208ENST00000562744 491 ntTSL 415.3■□□□□ 0.042e-10■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 PLEKHG4-202ENST00000379344 4513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.352e-10■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 PLEKHG4-204ENST00000427155 4455 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.362e-10■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 PLEKHG4-206ENST00000562144 574 ntTSL 411.33□□□□□ -0.62e-10■■■■■ 47.9
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DDX3XO00571 PLEKHG4-210ENST00000565773 542 ntTSL 49.73□□□□□ -0.852e-10■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 BMPR1A-205ENST00000638429 5632 ntTSL 517.89■□□□□ 0.453e-7■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.843e-7■■■■■ 47.9
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DDX3XO00571 RNF31-219ENST00000559882 554 ntTSL 423.2■■□□□ 1.31e-6■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 RNF31-210ENST00000559260 551 ntTSL 514.35□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 47.9
DDX3XO00571 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.671e-15■■■■■ 47.8
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DDX3XO00571 TMEM5-204ENST00000536219 864 ntTSL 1 (best)24.72■■□□□ 1.551e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.261e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.261e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.961e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 NAA35-203ENST00000416045 690 ntTSL 321.02■□□□□ 0.961e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.761e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.561e-9■■■■■ 47.8
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DDX3XO00571 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.452e-15■■■■■ 47.8
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DDX3XO00571 SLC25A17-214ENST00000458600 801 ntTSL 317.46■□□□□ 0.391e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 PIR-203ENST00000471725 514 ntTSL 317.34■□□□□ 0.371e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 COG2-204ENST00000473671 436 ntTSL 216.76■□□□□ 0.272e-18■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.171e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 ZNF714-207ENST00000616183 577 ntTSL 414.78□□□□□ -0.041e-20■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.141e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 PLS3-207ENST00000489283 926 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.142e-18■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 SLC25A17-208ENST00000434185 565 ntTSL 413.62□□□□□ -0.231e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.242e-18■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 COG2-203ENST00000468893 2784 ntTSL 213.46□□□□□ -0.252e-18■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 CHST10-212ENST00000487860 596 ntTSL 412.54□□□□□ -0.42e-18■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 COG2-202ENST00000366669 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.412e-18■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 ZNF714-206ENST00000613286 2696 ntTSL 1 (best)12.24□□□□□ -0.451e-20■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 RTCB-202ENST00000463455 628 ntTSL 212.07□□□□□ -0.481e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 SLC25A17-210ENST00000435456 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.591e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 SLC25A17-206ENST00000427084 749 ntTSL 511.34□□□□□ -0.591e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 ZNF714-205ENST00000610902 2671 ntTSL 211.04□□□□□ -0.641e-20■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 SLC25A17-213ENST00000449676 533 ntTSL 410.61□□□□□ -0.711e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 RTCB-201ENST00000216038 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.721e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 SLC25A17-201ENST00000263255 2058 ntTSL 1 (best)10.29□□□□□ -0.761e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 ZNF714-201ENST00000425625 2562 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.791e-20■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 SLC25A17-216ENST00000491545 2530 ntTSL 1 (best)9.81□□□□□ -0.841e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 COG2-201ENST00000366668 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.842e-18■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 ZNF714-203ENST00000596053 800 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.851e-20■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 ZNF714-210ENST00000620627 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.891e-20■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 CLCN7-207ENST00000564568 533 ntTSL 49.1□□□□□ -0.951e-9■■■■■ 47.8
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