RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567938.1

PLEKHG4-213, Transcript of pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G4, humanhuman

TSL 3

Gene PLEKHG4, Length 466 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHG4-213ENST00000567938 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.08■■■■■ 6.57
PLEKHG4-213ENST00000567938 ABCC9O60706 1549 aa50.36■■■■■ 5.65
PLEKHG4-213ENST00000567938 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.3■■■■■ 5.64
PLEKHG4-213ENST00000567938 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.93■■■■■ 5.26
PLEKHG4-213ENST00000567938 NACADO15069 1562 aa47.61■■■■■ 5.21
PLEKHG4-213ENST00000567938 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.41■■■■■ 5.18
PLEKHG4-213ENST00000567938 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.33■■■■■ 5.17
PLEKHG4-213ENST00000567938 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.95■■■■■ 5.11
PLEKHG4-213ENST00000567938 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.93■■■■■ 5.1
PLEKHG4-213ENST00000567938 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.8■■■■■ 5.08
PLEKHG4-213ENST00000567938 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.52■■■■■ 5.04
PLEKHG4-213ENST00000567938 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.44■■■■■ 5.03
PLEKHG4-213ENST00000567938 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.33■■■■■ 5.01
PLEKHG4-213ENST00000567938 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.92■■■■■ 4.94
PLEKHG4-213ENST00000567938 SCRIBQ14160 1630 aa45.81■■■■■ 4.92
PLEKHG4-213ENST00000567938 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.48■■■■■ 4.87
PLEKHG4-213ENST00000567938 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.39■■■■■ 4.86
PLEKHG4-213ENST00000567938 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.37■■■■■ 4.85
PLEKHG4-213ENST00000567938 NCAPD3P42695 1498 aa43.98■■■■■ 4.63
PLEKHG4-213ENST00000567938 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.82■■■■■ 4.6
PLEKHG4-213ENST00000567938 SMARCA4P51532 1647 aa43.73■■■■■ 4.59
PLEKHG4-213ENST00000567938 SMARCA2P51531 1590 aa43.69■■■■■ 4.58
PLEKHG4-213ENST00000567938 HMGXB3Q12766 1538 aa43.6■■■■■ 4.57
PLEKHG4-213ENST00000567938 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
PLEKHG4-213ENST00000567938 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.52■■■■■ 4.56
PLEKHG4-213ENST00000567938 ERCC6Q03468 1493 aa43.5■■■■■ 4.55
PLEKHG4-213ENST00000567938 CUX2O14529 1486 aa43.45■■■■■ 4.55
PLEKHG4-213ENST00000567938 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.53
PLEKHG4-213ENST00000567938 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.32■■■■■ 4.52
PLEKHG4-213ENST00000567938 NESP48681 1621 aa43.25■■■■■ 4.51
PLEKHG4-213ENST00000567938 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.2■■■■■ 4.51
PLEKHG4-213ENST00000567938 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.95■■■■■ 4.47
PLEKHG4-213ENST00000567938 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
PLEKHG4-213ENST00000567938 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.75■■■■■ 4.43
PLEKHG4-213ENST00000567938 WIZO95785 1651 aa42.66■■■■■ 4.42
PLEKHG4-213ENST00000567938 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.66■■■■■ 4.42
PLEKHG4-213ENST00000567938 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.65■■■■■ 4.42
PLEKHG4-213ENST00000567938 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.34■■■■■ 4.37
PLEKHG4-213ENST00000567938 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
PLEKHG4-213ENST00000567938 WDR62O43379 1518 aa42.21■■■■■ 4.35
PLEKHG4-213ENST00000567938 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.17■■■■■ 4.34
PLEKHG4-213ENST00000567938 CFTRP13569 1480 aa42.13■■■■■ 4.34
PLEKHG4-213ENST00000567938 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
PLEKHG4-213ENST00000567938 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.12■■■■■ 4.33
PLEKHG4-213ENST00000567938 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
PLEKHG4-213ENST00000567938 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.69■■■■■ 4.26
PLEKHG4-213ENST00000567938 PRDM2Q13029 1718 aa41.65■■■■■ 4.26
PLEKHG4-213ENST00000567938 TRIM41Q8WV44 630 aa41.56■■■■■ 4.24
PLEKHG4-213ENST00000567938 OSCARQ8IYS5 282 aa41.52■■■■■ 4.24
PLEKHG4-213ENST00000567938 IFT140Q96RY7 1462 aa41.34■■■■■ 4.21
PLEKHG4-213ENST00000567938 TOPBP1Q92547 1522 aa41.33■■■■■ 4.21
PLEKHG4-213ENST00000567938 ABCC8Q09428 1581 aa41.28■■■■■ 4.2
PLEKHG4-213ENST00000567938 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
PLEKHG4-213ENST00000567938 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.15■■■■■ 4.18
PLEKHG4-213ENST00000567938 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
PLEKHG4-213ENST00000567938 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
PLEKHG4-213ENST00000567938 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.91■■■■■ 4.14
PLEKHG4-213ENST00000567938 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
PLEKHG4-213ENST00000567938 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.89■■■■■ 4.14
PLEKHG4-213ENST00000567938 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.89■■■■■ 4.14
PLEKHG4-213ENST00000567938 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.89■■■■■ 4.14
PLEKHG4-213ENST00000567938 ARHGEF11O15085 1522 aa40.77■■■■■ 4.12
PLEKHG4-213ENST00000567938 SOGA1O94964 1423 aa40.76■■■■■ 4.11
PLEKHG4-213ENST00000567938 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.75■■■■■ 4.11
PLEKHG4-213ENST00000567938 CHD1O14646 1710 aa40.7■■■■■ 4.11
PLEKHG4-213ENST00000567938 FBLN2P98095 1184 aa40.68■■■■■ 4.1
PLEKHG4-213ENST00000567938 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
PLEKHG4-213ENST00000567938 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.63■■■■■ 4.09
PLEKHG4-213ENST00000567938 CUX1P39880 1505 aa40.58■■■■■ 4.09
PLEKHG4-213ENST00000567938 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.54■■■■■ 4.08
PLEKHG4-213ENST00000567938 WDR97A6NE52 1622 aa40.53■■■■■ 4.08
PLEKHG4-213ENST00000567938 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.46■■■■■ 4.07
PLEKHG4-213ENST00000567938 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
PLEKHG4-213ENST00000567938 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
PLEKHG4-213ENST00000567938 GRIN2BQ13224 1484 aa40.39■■■■■ 4.06
PLEKHG4-213ENST00000567938 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
PLEKHG4-213ENST00000567938 ARAP1Q96P48 1450 aa40.37■■■■■ 4.05
PLEKHG4-213ENST00000567938 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.25■■■■■ 4.03
PLEKHG4-213ENST00000567938 SYNJ1O43426 1573 aa40.24■■■■■ 4.03
PLEKHG4-213ENST00000567938 SYNJ2O15056 1496 aa40.24■■■■■ 4.03
PLEKHG4-213ENST00000567938 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.23■■■■■ 4.03
PLEKHG4-213ENST00000567938 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.18■■■■■ 4.02
PLEKHG4-213ENST00000567938 PBRM1Q86U86 1689 aa40.15■■■■■ 4.02
PLEKHG4-213ENST00000567938 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
PLEKHG4-213ENST00000567938 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.09■■■■■ 4.01
PLEKHG4-213ENST00000567938 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.04■■■■■ 4
PLEKHG4-213ENST00000567938 TOP2BQ02880 1626 aa39.92■■■■□ 3.98
PLEKHG4-213ENST00000567938 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.91■■■■□ 3.98
PLEKHG4-213ENST00000567938 GRIN2AQ12879 1464 aa39.84■■■■□ 3.97
PLEKHG4-213ENST00000567938 ADAMTS12P58397 1594 aa39.78■■■■□ 3.96
PLEKHG4-213ENST00000567938 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.74■■■■□ 3.95
PLEKHG4-213ENST00000567938 NUP160Q12769 1436 aa39.73■■■■□ 3.95
PLEKHG4-213ENST00000567938 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.68■■■■□ 3.94
PLEKHG4-213ENST00000567938 CEP170Q5SW79 1584 aa39.67■■■■□ 3.94
PLEKHG4-213ENST00000567938 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.62■■■■□ 3.93
PLEKHG4-213ENST00000567938 SHROOM2Q13796 1616 aa39.52■■■■□ 3.92
PLEKHG4-213ENST00000567938 JPH4Q96JJ6 628 aa39.38■■■■□ 3.89
PLEKHG4-213ENST00000567938 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.36■■■■□ 3.89
PLEKHG4-213ENST00000567938 IGF1RP08069 1367 aa39.21■■■■□ 3.87
PLEKHG4-213ENST00000567938 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.2■■■■□ 3.87
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