RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568621.1

PLEKHG4-214, Transcript of pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G4, humanhuman

TSL 3

Gene PLEKHG4, Length 514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHG4-214ENST00000568621 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.1■■■■■ 7.21
PLEKHG4-214ENST00000568621 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.33■■■■■ 6.13
PLEKHG4-214ENST00000568621 ABCC9O60706 1549 aa52.35■■■■■ 5.97
PLEKHG4-214ENST00000568621 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.38■■■■■ 5.66
PLEKHG4-214ENST00000568621 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.31■■■■■ 5.64
PLEKHG4-214ENST00000568621 NACADO15069 1562 aa50.27■■■■■ 5.64
PLEKHG4-214ENST00000568621 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.01■■■■■ 5.6
PLEKHG4-214ENST00000568621 MYO15BQ96JP2 1530 aa50■■■■■ 5.59
PLEKHG4-214ENST00000568621 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.74■■■■■ 5.55
PLEKHG4-214ENST00000568621 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.01■■■■■ 5.44
PLEKHG4-214ENST00000568621 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.95■■■■■ 5.43
PLEKHG4-214ENST00000568621 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.74■■■■■ 5.39
PLEKHG4-214ENST00000568621 SCRIBQ14160 1630 aa48.66■■■■■ 5.38
PLEKHG4-214ENST00000568621 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.32■■■■■ 5.33
PLEKHG4-214ENST00000568621 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.2■■■■■ 5.31
PLEKHG4-214ENST00000568621 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
PLEKHG4-214ENST00000568621 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.3■■■■■ 5.16
PLEKHG4-214ENST00000568621 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.08■■■■■ 5.13
PLEKHG4-214ENST00000568621 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.56■■■■■ 5.04
PLEKHG4-214ENST00000568621 SMARCA4P51532 1647 aa46.56■■■■■ 5.04
PLEKHG4-214ENST00000568621 NCAPD3P42695 1498 aa46.46■■■■■ 5.03
PLEKHG4-214ENST00000568621 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.43■■■■■ 5.02
PLEKHG4-214ENST00000568621 SMARCA2P51531 1590 aa46.35■■■■■ 5.01
PLEKHG4-214ENST00000568621 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.28■■■■■ 5
PLEKHG4-214ENST00000568621 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.15■■■■■ 4.98
PLEKHG4-214ENST00000568621 HMGXB3Q12766 1538 aa46.12■■■■■ 4.97
PLEKHG4-214ENST00000568621 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.02■■■■■ 4.96
PLEKHG4-214ENST00000568621 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.8■■■■■ 4.92
PLEKHG4-214ENST00000568621 WIZO95785 1651 aa45.7■■■■■ 4.91
PLEKHG4-214ENST00000568621 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.28■■■■■ 4.84
PLEKHG4-214ENST00000568621 NESP48681 1621 aa45.26■■■■■ 4.84
PLEKHG4-214ENST00000568621 ERCC6Q03468 1493 aa45.16■■■■■ 4.82
PLEKHG4-214ENST00000568621 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.14■■■■■ 4.82
PLEKHG4-214ENST00000568621 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.13■■■■■ 4.82
PLEKHG4-214ENST00000568621 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.96■■■■■ 4.79
PLEKHG4-214ENST00000568621 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.81■■■■■ 4.76
PLEKHG4-214ENST00000568621 CFTRP13569 1480 aa44.79■■■■■ 4.76
PLEKHG4-214ENST00000568621 CUX2O14529 1486 aa44.71■■■■■ 4.75
PLEKHG4-214ENST00000568621 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.66■■■■■ 4.74
PLEKHG4-214ENST00000568621 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.58■■■■■ 4.73
PLEKHG4-214ENST00000568621 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.53■■■■■ 4.72
PLEKHG4-214ENST00000568621 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
PLEKHG4-214ENST00000568621 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.47■■■■■ 4.71
PLEKHG4-214ENST00000568621 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.42■■■■■ 4.7
PLEKHG4-214ENST00000568621 WDR62O43379 1518 aa44.24■■■■■ 4.67
PLEKHG4-214ENST00000568621 PRDM2Q13029 1718 aa44.18■■■■■ 4.66
PLEKHG4-214ENST00000568621 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
PLEKHG4-214ENST00000568621 ABCC8Q09428 1581 aa43.87■■■■■ 4.61
PLEKHG4-214ENST00000568621 TOPBP1Q92547 1522 aa43.79■■■■■ 4.6
PLEKHG4-214ENST00000568621 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.7■■■■■ 4.59
PLEKHG4-214ENST00000568621 IFT140Q96RY7 1462 aa43.57■■■■■ 4.57
PLEKHG4-214ENST00000568621 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.53■■■■■ 4.56
PLEKHG4-214ENST00000568621 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
PLEKHG4-214ENST00000568621 CUX1P39880 1505 aa43.41■■■■■ 4.54
PLEKHG4-214ENST00000568621 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.33■■■■■ 4.53
PLEKHG4-214ENST00000568621 SOGA1O94964 1423 aa43.33■■■■■ 4.53
PLEKHG4-214ENST00000568621 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.3■■■■■ 4.52
PLEKHG4-214ENST00000568621 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
PLEKHG4-214ENST00000568621 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.24■■■■■ 4.51
PLEKHG4-214ENST00000568621 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.19■■■■■ 4.5
PLEKHG4-214ENST00000568621 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.13■■■■■ 4.5
PLEKHG4-214ENST00000568621 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.49
PLEKHG4-214ENST00000568621 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.48
PLEKHG4-214ENST00000568621 TOP2BQ02880 1626 aa43■■■■■ 4.47
PLEKHG4-214ENST00000568621 OSCARQ8IYS5 282 aa42.99■■■■■ 4.47
PLEKHG4-214ENST00000568621 SYNJ1O43426 1573 aa42.96■■■■■ 4.47
PLEKHG4-214ENST00000568621 WDR97A6NE52 1622 aa42.95■■■■■ 4.47
PLEKHG4-214ENST00000568621 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.95■■■■■ 4.47
PLEKHG4-214ENST00000568621 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.91■■■■■ 4.46
PLEKHG4-214ENST00000568621 GRIN2BQ13224 1484 aa42.79■■■■■ 4.44
PLEKHG4-214ENST00000568621 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.78■■■■■ 4.44
PLEKHG4-214ENST00000568621 FBLN2P98095 1184 aa42.7■■■■■ 4.43
PLEKHG4-214ENST00000568621 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.68■■■■■ 4.42
PLEKHG4-214ENST00000568621 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.67■■■■■ 4.42
PLEKHG4-214ENST00000568621 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.63■■■■■ 4.41
PLEKHG4-214ENST00000568621 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
PLEKHG4-214ENST00000568621 SYNJ2O15056 1496 aa42.5■■■■■ 4.39
PLEKHG4-214ENST00000568621 PBRM1Q86U86 1689 aa42.48■■■■■ 4.39
PLEKHG4-214ENST00000568621 CHD1O14646 1710 aa42.47■■■■■ 4.39
PLEKHG4-214ENST00000568621 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.37■■■■■ 4.37
PLEKHG4-214ENST00000568621 KIF27Q86VH2 1401 aa42.33■■■■■ 4.37
PLEKHG4-214ENST00000568621 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.31■■■■■ 4.36
PLEKHG4-214ENST00000568621 ADAMTS12P58397 1594 aa42.23■■■■■ 4.35
PLEKHG4-214ENST00000568621 TRIM41Q8WV44 630 aa42.23■■■■■ 4.35
PLEKHG4-214ENST00000568621 GRIN2AQ12879 1464 aa42.2■■■■■ 4.35
PLEKHG4-214ENST00000568621 IGF1RP08069 1367 aa42.19■■■■■ 4.34
PLEKHG4-214ENST00000568621 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.12■■■■■ 4.33
PLEKHG4-214ENST00000568621 ARHGEF11O15085 1522 aa42.1■■■■■ 4.33
PLEKHG4-214ENST00000568621 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.06■■■■■ 4.32
PLEKHG4-214ENST00000568621 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.06■■■■■ 4.32
PLEKHG4-214ENST00000568621 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.06■■■■■ 4.32
PLEKHG4-214ENST00000568621 NUP160Q12769 1436 aa42.04■■■■■ 4.32
PLEKHG4-214ENST00000568621 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.93■■■■■ 4.3
PLEKHG4-214ENST00000568621 CEP170Q5SW79 1584 aa41.93■■■■■ 4.3
PLEKHG4-214ENST00000568621 CUL7Q14999 1698 aa41.9■■■■■ 4.3
PLEKHG4-214ENST00000568621 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.87■■■■■ 4.29
PLEKHG4-214ENST00000568621 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.84■■■■■ 4.29
PLEKHG4-214ENST00000568621 ARAP1Q96P48 1450 aa41.77■■■■■ 4.28
PLEKHG4-214ENST00000568621 JPH4Q96JJ6 628 aa41.74■■■■■ 4.27
PLEKHG4-214ENST00000568621 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.65■■■■■ 4.26
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