Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TULP2O00295 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TULP2O00295 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TULP2O00295 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TULP2O00295 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TULP2O00295 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TULP2O00295 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP2O00295 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP2O00295 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP2O00295 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP2O00295 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP2O00295 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP2O00295 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP2O00295 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP2O00295 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP2O00295 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP2O00295 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP2O00295 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP2O00295 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP2O00295 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP2O00295 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP2O00295 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP2O00295 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP2O00295 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP2O00295 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP2O00295 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP2O00295 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP2O00295 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TULP2O00295 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TULP2O00295 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TULP2O00295 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TULP2O00295 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TULP2O00295 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TULP2O00295 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TULP2O00295 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TULP2O00295 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TULP2O00295 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TULP2O00295 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TULP2O00295 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TULP2O00295 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TULP2O00295 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TULP2O00295 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TULP2O00295 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TULP2O00295 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TULP2O00295 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TULP2O00295 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TULP2O00295 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TULP2O00295 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TULP2O00295 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TULP2O00295 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TULP2O00295 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TULP2O00295 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TULP2O00295 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TULP2O00295 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TULP2O00295 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TULP2O00295 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TULP2O00295 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TULP2O00295 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TULP2O00295 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TULP2O00295 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TULP2O00295 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TULP2O00295 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TULP2O00295 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TULP2O00295 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TULP2O00295 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TULP2O00295 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TULP2O00295 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TULP2O00295 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TULP2O00295 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TULP2O00295 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TULP2O00295 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TULP2O00295 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TULP2O00295 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TULP2O00295 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TULP2O00295 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TULP2O00295 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TULP2O00295 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TULP2O00295 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TULP2O00295 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TULP2O00295 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TULP2O00295 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TULP2O00295 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TULP2O00295 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TULP2O00295 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TULP2O00295 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TULP2O00295 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TULP2O00295 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TULP2O00295 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TULP2O00295 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TULP2O00295 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TULP2O00295 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TULP2O00295 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TULP2O00295 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TULP2O00295 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TULP2O00295 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TULP2O00295 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TULP2O00295 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TULP2O00295 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TULP2O00295 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TULP2O00295 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms