Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFXAPO00287 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFXAPO00287 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFXAPO00287 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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