Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFKBIEO00221 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFKBIEO00221 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms