Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMIM22K7EJ46 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMIM22K7EJ46 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms