Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
I3L3M4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
I3L3M4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
I3L3M4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
I3L3M4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
I3L3M4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
I3L3M4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
I3L3M4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
I3L3M4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
I3L3M4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
I3L3M4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
I3L3M4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
I3L3M4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
I3L3M4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
I3L3M4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
I3L3M4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
I3L3M4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
I3L3M4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
I3L3M4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
I3L3M4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
I3L3M4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
I3L3M4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
I3L3M4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
I3L3M4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
I3L3M4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
I3L3M4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
I3L3M4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
I3L3M4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
I3L3M4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
I3L3M4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
I3L3M4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
I3L3M4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
I3L3M4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
I3L3M4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
I3L3M4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
I3L3M4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
I3L3M4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
I3L3M4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
I3L3M4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
I3L3M4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
I3L3M4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
I3L3M4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
I3L3M4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
I3L3M4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
I3L3M4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
I3L3M4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
I3L3M4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
I3L3M4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
I3L3M4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
I3L3M4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
I3L3M4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
I3L3M4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
I3L3M4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
I3L3M4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
I3L3M4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
I3L3M4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
I3L3M4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
I3L3M4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
I3L3M4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
I3L3M4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
I3L3M4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
I3L3M4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
I3L3M4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
I3L3M4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
I3L3M4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
I3L3M4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
I3L3M4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
I3L3M4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
I3L3M4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
I3L3M4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
I3L3M4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
I3L3M4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
I3L3M4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
I3L3M4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
I3L3M4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
I3L3M4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
I3L3M4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
I3L3M4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
I3L3M4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
I3L3M4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
I3L3M4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
I3L3M4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
I3L3M4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
I3L3M4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
I3L3M4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
I3L3M4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
I3L3M4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
I3L3M4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
I3L3M4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
I3L3M4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
I3L3M4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
I3L3M4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
I3L3M4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
I3L3M4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
I3L3M4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
I3L3M4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
I3L3M4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
I3L3M4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
I3L3M4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
I3L3M4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms