Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H7C1H1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H7C1H1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
H7C1H1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H7C1H1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H7C1H1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
H7C1H1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H7C1H1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H7C1H1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H7C1H1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H7C1H1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H7C1H1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H7C1H1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H7C1H1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H7C1H1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H7C1H1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
H7C1H1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H7C1H1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H7C1H1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H7C1H1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H7C1H1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H7C1H1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H7C1H1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H7C1H1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H7C1H1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H7C1H1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H7C1H1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H7C1H1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H7C1H1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H7C1H1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H7C1H1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H7C1H1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H7C1H1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H7C1H1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H7C1H1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H7C1H1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H7C1H1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H7C1H1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H7C1H1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H7C1H1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H7C1H1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H7C1H1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H7C1H1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H7C1H1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H7C1H1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H7C1H1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H7C1H1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H7C1H1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H7C1H1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H7C1H1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H7C1H1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H7C1H1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H7C1H1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H7C1H1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H7C1H1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H7C1H1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H7C1H1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H7C1H1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H7C1H1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H7C1H1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H7C1H1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H7C1H1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H7C1H1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H7C1H1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
H7C1H1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H7C1H1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H7C1H1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H7C1H1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H7C1H1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H7C1H1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H7C1H1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H7C1H1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H7C1H1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H7C1H1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H7C1H1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H7C1H1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H7C1H1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H7C1H1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H7C1H1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H7C1H1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H7C1H1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H7C1H1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H7C1H1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H7C1H1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H7C1H1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H7C1H1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H7C1H1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H7C1H1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H7C1H1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H7C1H1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H7C1H1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H7C1H1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H7C1H1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H7C1H1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H7C1H1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H7C1H1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H7C1H1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H7C1H1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H7C1H1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H7C1H1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms