Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms