Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HHLA1C9JL84 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HHLA1C9JL84 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HHLA1C9JL84 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms