Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4E171 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4E171 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
B4E171 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
B4E171 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4E171 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4E171 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4E171 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4E171 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4E171 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4E171 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4E171 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4E171 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4E171 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4E171 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4E171 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4E171 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4E171 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4E171 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4E171 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4E171 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4E171 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4E171 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4E171 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4E171 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4E171 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4E171 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
B4E171 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4E171 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4E171 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4E171 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4E171 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4E171 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4E171 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4E171 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4E171 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4E171 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4E171 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4E171 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4E171 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4E171 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4E171 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4E171 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4E171 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4E171 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
B4E171 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B4E171 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B4E171 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B4E171 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B4E171 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B4E171 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4E171 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
B4E171 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4E171 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4E171 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4E171 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4E171 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4E171 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4E171 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4E171 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4E171 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4E171 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4E171 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4E171 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4E171 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4E171 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4E171 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4E171 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4E171 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4E171 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4E171 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4E171 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B4E171 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B4E171 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B4E171 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B4E171 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
B4E171 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B4E171 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B4E171 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B4E171 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4E171 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4E171 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4E171 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4E171 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4E171 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4E171 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4E171 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4E171 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4E171 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4E171 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4E171 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4E171 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4E171 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
B4E171 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4E171 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4E171 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
B4E171 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4E171 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4E171 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4E171 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms