Protein–RNA interactions for Protein: B4DLN1

cDNA FLJ60124, highly similar to Mitochondrial dicarboxylate carrier, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DLN1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4DLN1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
B4DLN1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4DLN1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4DLN1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4DLN1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4DLN1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4DLN1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
B4DLN1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4DLN1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4DLN1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4DLN1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4DLN1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4DLN1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4DLN1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4DLN1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4DLN1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4DLN1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4DLN1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4DLN1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4DLN1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4DLN1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4DLN1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4DLN1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4DLN1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4DLN1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4DLN1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4DLN1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4DLN1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4DLN1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4DLN1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4DLN1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4DLN1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4DLN1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4DLN1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4DLN1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4DLN1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4DLN1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4DLN1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4DLN1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4DLN1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
B4DLN1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
B4DLN1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4DLN1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4DLN1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4DLN1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4DLN1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4DLN1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4DLN1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4DLN1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4DLN1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4DLN1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
B4DLN1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4DLN1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4DLN1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
B4DLN1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
B4DLN1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
B4DLN1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
B4DLN1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
B4DLN1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
B4DLN1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
B4DLN1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
B4DLN1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
B4DLN1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
B4DLN1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
B4DLN1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
B4DLN1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
B4DLN1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
B4DLN1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
B4DLN1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
B4DLN1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
B4DLN1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
B4DLN1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
B4DLN1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
B4DLN1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
B4DLN1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
B4DLN1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
B4DLN1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
B4DLN1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
B4DLN1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
B4DLN1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
B4DLN1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
B4DLN1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
B4DLN1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
B4DLN1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
B4DLN1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
B4DLN1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
B4DLN1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
B4DLN1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
B4DLN1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
B4DLN1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
B4DLN1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
B4DLN1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
B4DLN1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
B4DLN1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
B4DLN1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
B4DLN1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
B4DLN1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
B4DLN1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
B4DLN1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms