Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ISM1B1AKI9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ISM1B1AKI9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms