Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3P2A8K0S8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3P2A8K0S8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms