Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP27XA6NNY8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP27XA6NNY8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
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