Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRRM3A6NNA2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms