Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW4

LRRC3C, Leucine-rich repeat-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3CA6NJW4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRC3CA6NJW4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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