Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms