Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM149AA5PLN7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM149AA5PLN7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM149AA5PLN7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms