Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LCHNA4D1U4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms