Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC144AA2RUR9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC144AA2RUR9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms