Protein–RNA interactions for Protein: A1A4G5

LNP1, Leukemia NUP98 fusion partner 1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNP1A1A4G5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LNP1A1A4G5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LNP1A1A4G5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms