Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CCL27Q9Y4X3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CCL27Q9Y4X3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CCL27Q9Y4X3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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