Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD54L2Q9Y4B4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD54L2Q9Y4B4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD54L2Q9Y4B4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD54L2Q9Y4B4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms