Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTF2Q9UNY4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms