Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms