Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms