Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms