Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms