Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms