Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV8

CEP41, Centrosomal protein of 41 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP41Q9BYV8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP41Q9BYV8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms