Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms