Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms