Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms