Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms