Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms