Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms