Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms