Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LGMNQ99538 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms