Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYCBPQ99417 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms