Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCF12Q99081 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1114.3 ms