Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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