Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms