Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms