Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUB2Q96DC9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms